В соревнованиях участвуют 20 лучших командЦентрального и Южного федеральных округов. На предварительном этапе они были разбиты на 5 групп по 4 команды в каждой. Для попадания в 8 лучших и продолжения борьбы в четвертьфинале необходимо было либо стать победителем своей группы, либо попасть в число 3 лучших команд, занявших 2 место.
Соперниками ЦСКА-2006 по группе стали футболисты Академии «Ротора» (Волгоград), Салюта (Белгород) и «Кванта» (Обнинск). Первая игра у смолян была с самым сильным соперником – командой «Салют». Тяжелый матч завершился минимальной победой белгородцев со счетом 1:0. Во второй игре смоленские армейцы уверенно победили «Ротор» со счетом 5:0. В 3 матче ЦСКА-2006 победил «Квант» со счетом 3:0. К сожалению, эти 2 победы принесли армейцам лишь 2 место в группе, так как «Салют», также победив «Ротор» и «Квант», занял первое место в группе. Но уверенные победы позволили ЦСКА-2006 попасть в тройку лучших вторых команд группового турнира, что дало им возможность продолжить борьбу за победу в Первенстве.
В четвертьфинале Первенства ЦСКА-2006 встретится с командой «Академия футбола»(Тамбов).