Свою трудовую деятельность в Спортивном клубе армии Санкт-Петербурга Эдуард Большаков начал в 1978 году. В настоящее время он является одним из ведущих тренеров комплексной СДЮШОР по лёгкой атлетике и использует самые передовые методы современной спортивной тренировки.

За многолетний период тренерской деятельности Эдуард Большаков подготовил большую группу спортсменов: четыре Мастера спорта международного класса (Наталья Кузнецова, Игорь Конышев, Павел Андреев, Сергей Лукин), 15 мастеров спорта СССР и России, которые успешно выступали на чемпионатах и Кубках Европы, чемпионатах СССР и России.

Эдуард Николаевич активно работает в судейской коллегии Санкт-Петербурга, имеет республиканскую судейскую категорию. В 2002 году получил почётное звание «Отличник физической культуры». В 2013 году награждён медалью «За укрепление боевого содружества». Также неоднократно награждён грамотами Командующего Ленинградского военного округа за умелую организацию физической подготовки и большой вклад в спортивную работу.